碳源在污水处理厂的使用主要分为提供微生物合成菌体繁殖的主要营养、反硝化的电子供体、生物除磷协助聚磷菌释放。也可以说碳源就是污水厂维持微生物生长最主要的原料之一。
废水处理所用碳源通常被认为是含碳元素并容易被微生物利用，促进微生物生长的营养物质。是常说的短碳链、简单分子结构的含碳有机物。比如：单糖、多糖类，油脂类，有机酸类、酯类及小分子醇类。微生物降解有机物的过程中，其中关键酶、中间产物的差异，作用的微生物菌不一样，也就是说不同的碳源降解的生物途径存在差异。
在碳源被微生物分解过程中，即细胞合成维持细胞的生命活动、生长代谢的能量就是碳源提供的，碳源可认为是细胞生命活动所需的能量供给者，微生物菌胶团形成的框架。
维持微生物所需要的能量。污水处理菌种生化调试培养需要投加碳源、氮源、磷源，微生物在生化池中繁殖需要大量的能量，在培养过程中污水的进出水口需要关闭几天，没有污水流进，没有补充营养源，微生物在繁殖没有食物饮食，从而导致死亡。在调试培养微生物碳源严重不足会影响生化过程，脱氮除磷能力与效率主要因素。
